「横浜に生きた人々の歴史」をテーマに、2万年にわたる横浜市域の歴史を展示しています。円形の常設展示室内は、原始から近現代までの時代ごとに6つの部屋に分かれています。決められた順路がありませんので、どの時代からも見ることができます。博物館に隣接して、国指定史跡「大塚・歳勝土遺跡」を中心とした遺跡公園があり、弥生時代の竪穴住居・環濠・墓地が復元されています。